לאחר הצמדת חומר עבודה פעם אחת במרכז העיבוד, מערכת הבקרה הדיגיטלית יכולה לשלוט בכלי המכונה כדי לבחור ולשנות כלים באופן אוטומטי בהתאם לתהליכים שונים, לשנות אוטומטית את מהירות הציר, קצב ההזנה ומסלול תנועת הכלים ביחס לחומר העבודה, ופונקציות עזר אחרות להשלמת עיבוד של מספר תהליכים מרובים על מספר משטחים של חומר העבודה. יש לו גם מספר פונקציות של החלפת כלים או בחירת כלי, ובכך משפרת מאוד את יעילות הייצור.
מרכז עיבוד אנכי מתייחס למרכז עיבוד שבו ציר הציר מוגדר בניצב לשולחן העבודה. הוא מתאים בעיקר לעיבוד של חלקים מורכבים בצורת- צלחת, בצורת- דיסק, בצורת- תבנית וחלקים מורכבים בצורת מעטפת-. מרכזי עיבוד אנכיים יכולים לבצע פעולות כרסום, קידוח, קידוח, הקשה וחיתוך הברגה. יש צורך במינימום של שלושה-צירים שניים-מרכזי עיבוד הצמדות, ובדרך כלל אפשרית קישור של שלושה-צירים שלוש-. חלקם יכולים לבצע בקרת חמישה-צירים או שישה-צירים. גובה העמודה של מרכז עיבוד אנכי מוגבל, מה שמקטין את טווח העיבוד של חלקי עבודה בצורת-תיבה; זהו חסרון של מרכזי עיבוד אנכיים. עם זאת, מרכזי עיבוד אנכיים מציעים יתרונות כגון הידוק ומיקום נוחים של חלקי עבודה; התבוננות קלה במסלול התנועה של כלי החיתוך; איתור באגים, בדיקה ומדידה נוחה של תוכנית; זיהוי בזמן של בעיות לכיבוי או שינוי; הקמה קלה של תנאי קירור; וגישה ישירה של נוזל חיתוך לכלי ולמשטח המעובד. יתר על כן, שלושת צירי הקואורדינטות מיושרים עם מערכת הקואורדינטות הקרטזית, מספקים תצוגה ברורה ואינטואיטיבית התואמת את השרטוטים, ומקלים על הסרת שבבים ונפילה, ומונעים שריטות על פני השטח המעובדים. בהשוואה למרכזי עיבוד אופקיים מקבילים, יש להם מבנה פשוט יותר, טביעת רגל קטנה יותר ומחיר נמוך יותר.
